案例1

eIF3f promotes tumour malignancy by remodelling fatty acid biosynthesis in hepatocellular carcinoma.

eIF3f 通过重塑肝细胞癌中的脂肪酸生物合成促进肿瘤恶性。

研究材料

脂肪酸代谢与肝细胞癌 （HCC） 密切相关。阐明影响 HCC 脂肪酸代谢的分子对于开发精准疗法非常重要。

研究思路

研究方法

蛋白质组学、非靶代谢组、IP-MS、单细胞转录组、 空间转录组、免疫组化

研究结论

与对照组相比，EIF3F-OE 组共检出 188 种上调、191 种下调的代谢物，以及 1094 种上调、718 种下调的蛋白。上调代谢物中，脂质及类脂分子占主导，主要包括棕榈酰辅酶 A和十八烷酸等脂肪酸，进一步印证了eIF3f 参与 HCC-FAM 重编程。通路富集分析显示，上调代谢物显著富集于多条 FAM 核心通路，尤其是不饱和脂肪酸合成及脂肪酸生物合成（FAB）。蛋白质组学分析鉴定到多个与脂肪酸生物合成（FAB）密切相关的关键酶显著上调，进一步突显 eIF3f 对代谢重编程向 FAB 倾斜的驱动作用。

eIF3f在 HCC 组织中上调，与不良预后相关。eIF3f 通过 K48 连接的去泛素化直接与长链酰基辅酶 A合成酶 4 （ACSL4） 相互作用并稳定，促进脂肪酸生物合成和恶性肿瘤。肿瘤微环境中脂肪酸水平的增加间接减少了 CD8 T 细胞浸润。磷酸化的 eIF3f 增强了 eIF3f 和 ACSL4 之间的相互作用。

eIF3f 是 HCC 精准治疗的潜在靶点。

案例2

DEPDC1 as a metabolic target regulates glycolysis in renal cell carcinoma through AKT/mTOR/HIF1α pathway

DEPDC1 作为代谢靶点通过 AKT/mTOR/HIF1α 通路调节肾细胞癌的糖酵解

研究材料

对14例RCC患者（包括3例对TKI产生耐药的活检样本）进行单

细胞RNA测序（scRNA-seq）。

两个队列（TMA30，n = 28；TMA2021，n = 70）。

研究思路

研究方法

单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示糖酵解在RCC的不良预后和耐药性中起着关键作用。

TCGA-KIRC、糖酵解基因集以及体内外实验明DEPDC1促进RCC的恶性进展和糖酵解。

转录组测序和非靶向代谢组学测序表明，DEPDC1可能通过AKT/mTOR/HIF1α途径调节RCC的糖酵解。

研究结论

本研究首次利用scRNA-seq揭示了糖酵解在RCC的不良预后和TKI耐药中起重要作用。此外，多组学分析发现DEPDC1可通过AKT/mTOR/HIFα通路促进RCC糖酵解和TKI耐药。本研究队列的临床结果表明，DEPDC1的高表达与RCC患者的不良预后和转移预测相关。总体而言，提出了一种新的葡萄糖代谢治疗靶点，用于治疗晚期TKI耐RCC患者。但本研究的研究仍然存在一定的局限性。下一步是探索DEPDC1如何调节AKT/mTOR/HIF1α通路和关键糖酵解酶，并验证DEPDC1在肾细胞癌原发性耐药肿瘤动物模型中的作用。