原核转录组
服务简介
转录组是指特定组织或细胞在某个时间或某个状态下转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和⾮编码RNA。在遗传中心法则中，mRNA是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带，处于重要的中央枢纽地位。基于Illumina测序平台的转录组测序技术（RNA-seq）能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下所转录的mRNA序列信息，从整体水平研究基因表达量以及基因结构，揭示特定生物学过程中的分子机理。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，现已广泛应用于生长发育、非生物胁迫、免疫互作、突变表型、临床诊断、药物研发和分子育种等领域[1]。
实验流程
RNA-seq实验流程包括样品检测、文库构建及质检和上机测序。RNA-seq是基于Illumina Novaseq 6000 测序平台，对真核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA进行测序，测序实验采用Illumina TruseqTM RNA sample prep Kit方法进行文库构建，其操作流程如下图所示：
分析流程
RNA-seq的核心是基因表达差异的显著性分析，使用统计学方法，比较两个条件或多个条件下的基因表达差异，从中找出与条件相关的特异性基因，然后进一步分析这些特异性基因的生物学意义，分析过程包括质控、比对、定量、差异显著性分析、功能富集等环节。生信分析流程如下图所示：
