10x 单细胞组学 | 广科安德

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10x 单细胞组学

服务简介

细胞异质性是肿瘤研究和诊断治疗中亟待解决的关键问题，为了解决这一问题，单细胞测序（single cell sequencing，SCS）技术应运而生。单细胞测序技术，是在单个细胞水平上，对基因组、转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术，可以研究单个细胞内的基因表达情况，同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题，让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为现实。
10x Genomics单细胞转录组测序平台利用微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获技术，能够10min内自动完成多至80,000个细胞的捕获，细胞捕获率最高65%，从而获得每个细胞的3’端的转录组信息。具有细胞通量高、建库成本低、捕获周期短等优势。该技术主要用于细胞分型和标记因子的鉴定，从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测，此外该技术还可以预测细胞分化与研究发育轨迹，在当下疾病、免疫、肿瘤领域以及组织、器官、发育研究中发挥越来越重要的作用。

技术路线

基于10x Genomics 平台使用微流控技术分选单个细胞，然后将带有barcode和引物的凝胶珠以及单个细胞包裹在油滴中；在油滴中凝胶珠溶解释放反转录oligo，细胞裂解释放mRNA，通过SMART法获得用于测序的带barcode的cDNA；液体油层破坏后，cDNA进行后续文库构建，使用Illumina测序平台检测，即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据。