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10x Visium HD空间转录组
服务简介
广科安德10x Visium HD空间转录组产品通过高分辨率仪器从样本中获取切片不同位置细胞中转录组数据,并将组织学和基因表达分析相结合,通过特有数据分析方法进行基因表达和形态学数据的可视化。广科安德10x Visium HD空间转录组技术提供一流数据,精细化解析复杂微小结构,助力肿瘤免疫微环境等研究,使得空转迈入单细胞精度时代。
实验流程
广科安德10x Visium HD目前仅适用于人和小鼠,为获得理想的测序数据结果,应确保组织样本的细胞核形态正常、有高质量的RNA以及在实验过程中不会出现脱片等异常情况。Visium HD的实验流程包括以下主要实验步骤:
生信分析
测序完成后,广科安德使用10x Genomics官方分析软件Space Ranger v3.0对原始数据进行数据过滤,以Xisium slide的显微镜图像和Fastq文件作为输入来计算组织的空间基因表达。
适用样本
数据分析流程
广科安德10x Visium HD空间转录组数据分析基本流程如下图所示:
服务优势
样本兼容性高:10x Visium HD适用样本类型拓展到FFPE、FF、FxF,允许检测长期保存的更多的样本类型。
单细胞分辨率:10x Visium HD系统将Visium平台的分辨率从55 μm spots提高到2x2 μm正方形,从而实现单细胞水平的空间组织结构分析,在组织切片上精确地定位和量化基因表达。
助力临床研究:10x Visium HD技术能够精细地映射细胞类型在肿瘤微环境中的空间分布,便于了解细胞间的相互作用和它们对肿瘤进展的影响。
广科安德可提供单细胞/空间组、基因组、表观组、微生物组、蛋白质组等多组学测序和生物信息学分析服务,从基础研究、转化研究到临床应用提供全方位科研技术服务及解决方案欢迎免费咨询,了解更多详细信息!我们的技术专员可免费为您提供业务评估。
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