科技服务
10x FFPE 单细胞转录组
服务简介
单细胞技术依然面临诸多挑战,其中最大的困境是,目前绝大部分高通量单细胞测序平台对待测样本的细胞活性要求较高,但临床的大部分样本为冻存或福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)处理的组织,细胞活性极低,很难利用现有的单细胞技术进行有效检测。广科安德10x Genomics平台的FFPE样本的单细胞核测序方法--snPATHO-seq,该方法能够对1~2张大于25μm的FFPE切片高通量检测细胞核转录组,并实现细胞分群。解决了以往polyA方式无法捕获片段化转录本的问题。
技术路线
有别于新鲜解离单细胞转录组测序基于polyA捕获的方法,RNA固定处理的样本或FFPE样本采用的是利用探针杂交捕获基因的方法,探针组作用包括检测基因表达与提供分组信息。

FLEX配套的杂交探针包括LHS和RHS类似左右2个抓手,可增强杂交的特异性,RHS上包含区分样本来源的ProbeBarcode,每个样本与不同的探针进行杂交,数据分析时可通过识别不同的Barcode将不同样本来源的Read区分开。FLEX配套芯片有8个通道,单个通道可以混合4个样本。由于探针具有物种特异性,目前FLEX方案仅可应用于人和小鼠样本。
技术路线
应用领域
肿瘤微环境
细胞特异性
生物发育等领域
广科安德可提供单细胞/空间组、基因组、表观组、微生物组、蛋白质组等多组学测序和生物信息学分析服务,从基础研究、转化研究到临床应用提供全方位科研技术服务及解决方案欢迎免费咨询,了解更多详细信息!我们的技术专员可免费为您提供业务评估。
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