技术路线
有别于新鲜解离单细胞转录组测序基于polyA捕获的方法,RNA固定处理的样本或FFPE样本采用的是利用探针杂交捕获基因的方法,探针组作用包括检测基因表达与提供分组信息。
FLEX配套的杂交探针包括LHS和RHS类似左右2个抓手,可增强杂交的特异性,RHS上包含区分样本来源的ProbeBarcode,每个样本与不同的探针进行杂交,数据分析时可通过识别不同的Barcode将不同样本来源的Read区分开。FLEX配套芯片有8个通道,单个通道可以混合4个样本。由于探针具有物种特异性,目前FLEX方案仅可应用于人和小鼠样本。