10x Multiome ATAC + Gene Expression
服务简介
随着单细胞测序技术快速普及，仅仅是单细胞转录组层面已经不足以全面解决问题，因为在高度协调的生物系统中，从基因到转录本再到蛋白会受到各种途径的调控，包括表观基因组调控和各种DNA/RNA修饰的调控，因此结合scATAC可以分析单细胞级别的染色质可及性，结合单细胞蛋白质组学可以分析细胞内部和细胞表面的蛋白质表达情况，有助于深入认知各种生理现象背后的机制。
产品提供了一种综合的、可伸缩的多组学方法，用于检测同一单个细胞核中的转录组信息和染色质可及性信息。与独立的Chromium Next GEM单细胞ATACv1.1和Chromium Next GEM单细胞基因表达v3.1分析相比，这种多组学方法提供了一种可同时获取同一个单细胞的基因组开放数据和转录组表达水平数据的技术，从而使研究人员可以将不同生物事件中的各种单细胞的基因组染色质开放信息与基因表达程度进行准确关联，以便更好地在细胞和分子水平上对发育遗传学、神经科学、免疫组学、肿瘤和其它疾病机理等关键生命科学领域开展深入研究。
技术路线
为同时获得同一细胞的转录组和表观组，首先利用Tn5转座酶对细胞核悬液进行核DNA转座，Tn5转座酶优先切割开放染色质区域中的核DNA。然后利用Chromium平台进行单细胞基因表达（GEX）和ATAC文库制备，该过程将单个细胞核、反应试剂与单个凝胶珠（Gel Bead）包裹成液滴（GEM）。凝胶珠同时包括带有特异性条形码、唯一分子标识符（UMI）的poly(dT)序列和带有10x Barcode的Spacer序列，poly(dT)序列能够捕获具有poly(dA)尾的mRNA用于生成基因表达（GEX）文库，Spacer序列能够将条形码添加到转座的DNA片段上生成ATAC文库。对得到的两种文库进行测序，并将来自同一细胞两种文库的测序数据通过10x Barcode匹配，即可实现同时对同一细胞的转录组和表观组进行关联。
应用领域
发育遗传学
神经科学
免疫组学
肿瘤
其它疾病机理
仪器设备
10x Genomics Chromium X Series
广科安德可提供单细胞/空间组、基因组、表观组、微生物组、蛋白质组等多组学测序和生物信息学分析服务，从基础研究、转化研究到临床应用提供全方位科研技术服务及解决方案欢迎免费咨询，了解更多详细信息!我们的技术专员可免费为您提供业务评估。
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