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服务简介
细胞异质性是肿瘤研究和诊断治疗中亟待解决的关键问题,为了解决这一问题,单细胞测序(single cell sequencing,SCS)技术应运而生。单细胞测序技术,是在单个细胞水平上,对基因组、转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为现实。
广科安德10x Genomics自动分选细胞平台,实现对单个细胞5'转录本的反转录和扩增,可同时制备单细胞5'转录组文库和免疫组库V(D)J文库。能够在7分钟内完成多至80,000个细胞的自动分选,每个油滴包裹凝胶珠(GEM)中含有单个细胞和逆转录反应体系,可同时获取单细胞5'基因表达数据和TCR/BCR 的V(D)J重排信息,深入探究细胞免疫反应的复杂性,在免疫学和免疫肿瘤学中有着广泛的应用前景。
技术路线
B细胞或者T细胞里,V(D)J 区段是在mRNA 的5'端,所以和Gel Bead表面携带的Barcode和UMI所在的核算序列紧挨着的是mRNA的5‘端,以便捕获全长的V(D)J序列。GEMs的生成,每个GEM里含有Gel Beads、单个细胞、酶的混合物,在每一个单独的GEM里,除了 Gel Bead表面携带的Barcode和UMI所在的核酸序列,还有游离的poly-dT作为引物来结合RNA 3'端 poly(A)尾巴来扩增得到全长cDNA,这一步是发生在每个GEM内部。GEM裂解后,所有细胞cDNA混在一起进行扩增以达到建库要求,扩增后的产物分成2份或3份同时进行TCR/BCR的巢式PCR扩增V(D)J文库构建和常规5’单细胞转录组文库构建,获得每个细胞表达谱和V(D)J全长序列。来自同一细胞的VDJ文库序列和转录组文库序列有相同的细胞标签(Barcode),这样每个细胞转录组数据可以对应该细胞的V(D)J信息。
应用领域
肿瘤生物学:肿瘤细胞异质性、肿瘤微环境、免疫肿瘤学、癌症治疗
细胞免疫学:构建免疫图谱、免疫细胞分化、免疫缺陷i疾病研究
发育生物学:脑发育研究、胚胎发育倾向、基因表达时序性研究
神经生物学:神经细胞发育过程、不同区域神经细胞功能、神经类疾病研究
干细胞研究:干细胞分类、干细胞分化研究
仪器设备
10x Genomics Chromium X Series
广科安德可提供单细胞/空间组、基因组、表观组、微生物组、蛋白质组等多组学测序和生物信息学分析服务,从基础研究、转化研究到临床应用提供全方位科研技术服务及解决方案欢迎免费咨询,了解更多详细信息!我们的技术专员可免费为您提供业务评估。
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