服务介绍 | 广科安德

空间组学

10x Visium HD空间转录组 10x Xenium单细胞空间原位转录组 Akoya PhenoCycler-Fusion单细胞原位空间蛋白组学

10x 单细胞组学 10x Multiome ATAC + Gene Expression 10x 单细胞免疫组库 10x FFPE 单细胞转录组 SeekOne® DD单细胞转录组 SeekOne® DD单细胞免疫组库 SeekOne® DD单细胞全序列转录组 SeekOne® DD FFPE单细胞转录组华大智造DNBelab C系列单细胞产品

蛋白质组学

TMT定量蛋白质组学非标(Label-free)定量蛋白质组学分析 Astral定量蛋白质组学分析定性蛋白质组学蛋白质修饰位点分析强强联合丨蛋白质组学+修饰蛋白质组学磷酸化修饰组学乙酰化修饰组学泛素化修饰组学琥珀酰化修饰组学糖基化修饰组学 DIA定量蛋白质组学分析 SILAC定量蛋白质组学分析 PRM靶向定量蛋白质组学蛋白质组学生信分析

基因组测序

微生物全基因组测序微生物多样性测序宏基因组测序人全基因组测序外显子组测序

代谢组学

非靶向代谢组学广靶脂质组学短链脂肪酸其他靶向代谢组学

转录调控组学

真核有参转录组真核无参转录组绝对定量转录组测序 miRNA测序（10M/20M） lncRNA测序 circRNA测序产品简介动物全转录组测序（miRNA建库+rRNA去除法）全转录组测序(miRNA建库+rRNA去除法+酶消化) 单细胞转录组测序(SMART)

微生物多样性测序

服务介绍生信分析经典案例

服务简介

微生物多样性分析是基于Illumina测序平台，利用双末端测序（Paired-end）的方法，构建小片段扩增子文库进行测序；通过对Reads拼接过滤，去噪，并进行物种注释及丰度分析，可以揭示样品的物种构成；进一步进行Alpha多样性分析（Alpha diversity）、Beta多样性分析（Beta diversity）、显著物种差异分析、功能预测分析等，可以挖掘样本之间的差异。

微生物多样性研究是以扩增序列变体为分子标记研究环境样品中微生物系统分类、物种构成，主要是基于编码核糖体RNA的核酸序列保守区进行的。细菌主要是基于16S区，真菌主要基于ITS区（内转录间区），真核生物主要基于18S区进行测序分析。16S rDNA是编码原核生物核糖体小亚基rRNA（16S rRNA）的DNA序列，18S rDNA是编码真核生物核糖体小亚基rRNA（18S rRNA）的DNA序列，ITS是编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA内转录间隔区序列。这些序列中既有保守区又有可变区，保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系，而高变序列区域则能体现物种间的差异[1-3]。

技术优势

重点研究环境样本中的微生物多样性；

采用先进的Illumina测序平台，经济高效地完成目标区域的序列变异和丰度检测，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。

应用领域

疾病诊断、治疗，微生物-宿主关联机制等医学领域；

植物产量、抗逆性，动物健康、疾病等农牧领域；

食品发酵生产、工业防腐蚀、生物材料、微生物能源等工业领域；

水体、沉积物、土壤等生态环境检测、微生物辅助的环境修复等生态领域。

参考文献

Hugerth, Luisa W, and Anders F Andersson. “Analysing Microbial Community Composition through Amplicon Sequencing: From Sampling to Hypothesis Testing.” *Frontiers in microbiology* vol. 8 1561. 4 Sep. 2017, doi:10.3389/fmicb.2017.01561

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